يقع المتحف فى الدور الأرضى بمبنى معامل كلية العلوم، ويعتبر المتحف الجيولوجى بالكلية من أهم المعالم التى يصر الزائرين وطلاب المدارس على زيارتها، بالإضافة الى أنه المكان المفضل لطلاب الجيولوجيا لمراجعة دروسهم العملية فيه نظرا لأنه يحتوى على مجموعات مختاره ومتميزة للأنواع المختلفة من الصخور الرسوبية والنارية والمتحولة ومجموعات المعادن والخامات الهامة وأحجار البناء، كما يحتوى على مجموعة متنوعة من الحفريات التى تغطى العصور الجيولوجية المختلفة من حقب الحياه القديمة وحتى الحقب الرابع ، كما يشمل المتحف على العديد من أصداف المحاريات الحديثة وخاصة القواقع والرخويات وايضا تشكيلة فريدة من الشعاب المرجانية التى يتميز بها البحر الأحمر. يوجد أيضا بالمتحف نمازج توضيحية لأنواع التراكيب الجيولوجية المختلفة وأنواع البلورات ومجسمات زجاجية لها لسهولة تعرف الطلاب عليها وفهمها.